File size: 19,973 Bytes
3c42f9f
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
{
    "significant_genes": {
        "Variable": [
            "DEFA6",
            "CALML3",
            "KRT2",
            "ADA",
            "ALDH4A1",
            "IGFALS",
            "ALDH1L1",
            "BEND5",
            "AMOTL1",
            "APBB1IP",
            "CCL25",
            "AOX2P",
            "BCL11B",
            "PAX2",
            "ANKRD20A3P",
            "TBATA",
            "ANKRD36",
            "ALDH5A1",
            "TTC21A",
            "ARL5C",
            "IL12A",
            "LRIT1",
            "MME",
            "AKAP17A",
            "ALLC",
            "AIRE",
            "AKT3",
            "APOBEC3F",
            "RHO",
            "ANKFY1",
            "ARSH",
            "DEFB134",
            "ACAT1",
            "ZNG1C",
            "DNAH3",
            "RSAD1",
            "PRSS16",
            "PEBP1",
            "PIM2",
            "TTTY18",
            "FOXN1",
            "GRK1",
            "SLC27A2",
            "LRRIQ1",
            "SLCO6A1",
            "NDUFB10",
            "PRSS38",
            "HCG4",
            "PRSS42P",
            "TTC16",
            "GNB5",
            "C4orf17",
            "SPAG4",
            "ALDH9A1",
            "OR4C13",
            "ALKBH1",
            "PPY2P",
            "KCNJ5-AS1",
            "AP4S1",
            "ZNF8",
            "NKX2-6",
            "ARPP21",
            "THSD4",
            "STOX1",
            "RAP2A",
            "ZYG11B",
            "KLRC3",
            "ADAMTS17",
            "MTCH2",
            "ATP10B",
            "OSBPL5",
            "FST",
            "CCL20",
            "CNBD1",
            "TNIP3",
            "OR51F2",
            "CTRB2",
            "BNIP3",
            "EYA2",
            "KRT35",
            "DHH",
            "RBBP7",
            "LIPC",
            "NRG1",
            "LCORL",
            "HOXA2",
            "SLC15A4",
            "LAYN",
            "ADCY6",
            "HES3",
            "C6orf52",
            "PLEKHN1",
            "RNASE7",
            "COPRS",
            "OR4K1",
            "TSPEAR-AS2",
            "SERPINB3",
            "DUSP7",
            "SLC7A2",
            "HNF4A",
            "POTEE",
            "OR6B3",
            "SNORD15A",
            "OR8K5",
            "FGF7P6",
            "ICOSLG",
            "STS",
            "OVCH1",
            "IGFBPL1",
            "OR10G7",
            "FBXL4",
            "CRAT",
            "UQCC1",
            "SNX18",
            "PCK2",
            "NTF4",
            "BAG1",
            "PCDHGB4",
            "PPFIBP2",
            "CELP",
            "OR11H12",
            "USP15",
            "KCNG4",
            "HSF4",
            "MCAM",
            "MAB21L2",
            "SCD5",
            "WFDC8",
            "KIAA1549L",
            "MIR29B2CHG",
            "OR52B2",
            "ADCY8",
            "ATP12A",
            "RBPJL",
            "ZFAT",
            "BLZF1",
            "MAPKAP1",
            "SCARB1",
            "LDLRAD4",
            "ANKRD49",
            "CAPN10",
            "OSER1",
            "FNDC4",
            "SLC29A4",
            "ATG4D",
            "GCM2",
            "HPD",
            "DEFB103A",
            "OR4F6",
            "TTTY9A",
            "KRT78",
            "HCRT",
            "ELP4",
            "KIRREL3-AS3",
            "PDGFD",
            "COX8C",
            "HSPA6",
            "CALR3",
            "RP1",
            "PRELID3A",
            "SPRR4",
            "CFAP43",
            "B3GALT5",
            "TP53I11",
            "UTF1",
            "EFS",
            "UMOD",
            "PCSK1",
            "RASSF8",
            "BST1",
            "OBP2B",
            "EFCAB3",
            "NPB",
            "ELOVL7",
            "FAM87B",
            "FBXO24",
            "OR2D2",
            "C1orf56",
            "ZNF106",
            "OR14J1",
            "DNAAF1",
            "METTL16",
            "ZNF554",
            "BPESC1",
            "CSNK1A1L",
            "SERPINB2",
            "IQGAP2",
            "MYO3A",
            "YEATS4",
            "TREML4",
            "UBE3C",
            "TRPC4AP",
            "MS4A13",
            "C22orf23",
            "NPPB",
            "HOGA1",
            "IL17RB",
            "PERM1",
            "SPZ1",
            "B3GALNT2",
            "DGKH",
            "C4BPA",
            "ARID4B",
            "SUSD1",
            "TBX6",
            "NSMCE3",
            "OR52E5",
            "FRZB",
            "C1QTNF12",
            "ASCL3",
            "TUBB2B"
        ],
        "Coefficient": [
            0.04063361658747972,
            0.03632617719734872,
            0.03253253490709118,
            0.029380264398378278,
            0.02096947427309031,
            0.015302356508187042,
            0.014473224988142902,
            0.013936381704937358,
            0.01376683037821863,
            0.01252518408692314,
            0.01074728144405196,
            0.010570100200467154,
            0.008252253147081041,
            0.007146444997889308,
            0.005898609307001265,
            0.005262864097712103,
            0.005196940991834039,
            0.004730050856801794,
            -0.00417497481865304,
            0.003807834502255212,
            0.003747511066210227,
            0.003663927855925939,
            0.003339933712404097,
            0.0031458985818258816,
            0.0031176622411828252,
            0.0031100761971409765,
            0.0030513382444884106,
            0.002694468905744383,
            0.00254580468002691,
            0.002457363381028319,
            0.0023283308493091646,
            0.002304559369889791,
            -0.002282193239543391,
            0.0022279559440443815,
            -0.0022220818392139907,
            -0.0020882352325817593,
            0.0019071978219685766,
            -0.0016939621188588802,
            -0.001678669588302927,
            0.0016639015189495432,
            0.0016571345608441745,
            -0.0015887963909329164,
            -0.0015579603916322147,
            -0.0014425106437138298,
            0.001413943255206709,
            -0.0014105406412919757,
            0.0013372732995787441,
            0.0012863124997891384,
            0.0012717047360035938,
            -0.001252117566338581,
            -0.0012301933984221866,
            -0.0011563008105640587,
            -0.0011547885215365216,
            0.0011444847012146045,
            0.0011398064065694586,
            0.0011094719070950806,
            0.0010925692521917695,
            0.0010541292188055293,
            0.0010495226940098533,
            -0.0010380265187559866,
            0.0010362734615916428,
            0.0009859844953656032,
            0.0009835950297488057,
            0.000972783613520484,
            -0.0009725736218744327,
            -0.0009469420837332525,
            -0.0009266309676768962,
            0.0009143631163060883,
            -0.0009096637781743605,
            0.0008932332880763542,
            0.0008645277075977668,
            -0.0008610038257558869,
            -0.0008508761771640148,
            0.0008471194896094227,
            0.0008391294833176689,
            -0.0008271808210862831,
            -0.0008267313850033544,
            -0.0008199610545344981,
            0.0008155223799991696,
            -0.0007607627838779005,
            -0.0007506805628974934,
            -0.0007278533916516125,
            -0.0007239779673456682,
            0.0007074709478877227,
            -0.0007010596195059898,
            0.0006971695194447078,
            -0.0006958850559545754,
            0.0006856844082252355,
            -0.0006817343616830612,
            0.000681415497160878,
            0.0006632752043798367,
            -0.0006220812171649354,
            0.0005974417422505228,
            -0.0005959176609887032,
            -0.000595452581837117,
            0.0005947491003239396,
            -0.0005896888535763898,
            0.0005868089000319379,
            -0.000575982698270285,
            0.0005487617811156098,
            0.0005437564026530849,
            0.0005395323499082296,
            0.0005022712185941551,
            0.0004962833958290652,
            0.0004897920913177036,
            -0.0004578373319884706,
            -0.0004375349760472477,
            0.0004298165997676344,
            0.0004268735295527226,
            -0.00041372255031712525,
            -0.000408762315885739,
            -0.00039858726492126694,
            -0.0003963680704346096,
            0.0003755708555202826,
            -0.0003747232285797829,
            0.00034144645544862025,
            0.0003327497495392166,
            0.0003193558686950745,
            -0.0003191779004841817,
            0.00031134671688545274,
            -0.00031117296344586613,
            -0.0003096961422832338,
            0.0003059687436125551,
            -0.0003053309989066917,
            -0.00029918311947697043,
            0.00029554904507768576,
            0.00029146134926082574,
            0.0002878168133366439,
            0.00028505618435281833,
            0.0002833198251276058,
            0.00028183875016488585,
            -0.0002679194122824961,
            0.00025869826467203876,
            0.00025544011496608776,
            0.00025497415911349526,
            0.00022455972414685935,
            0.0002237578137000742,
            -0.00021509043106461565,
            0.00021176868606978422,
            0.00021139202561835057,
            -0.00020546793705966438,
            -0.00020402315262593398,
            -0.00019040678133015615,
            -0.00018575776279132575,
            0.00018332845225946246,
            0.0001758028478328809,
            -0.00017065088693382548,
            0.0001694643196021586,
            0.000166196989397431,
            -0.00016285653387203744,
            0.00015376749414355699,
            -0.0001531538811221743,
            0.00014835714488676746,
            -0.00014714550666417592,
            -0.00014235699235983943,
            -0.0001397089248699129,
            0.00013736785339812113,
            0.00012395971223030778,
            -0.00012330775569945878,
            -0.00011562137653111245,
            -0.00010658128167952534,
            -0.00010388628269377861,
            9.673473659360305e-05,
            9.325018210691285e-05,
            9.233001650073214e-05,
            8.385411551081947e-05,
            8.05378744293964e-05,
            -7.992337169121352e-05,
            7.85296195273548e-05,
            7.547349951598908e-05,
            -6.640654164327383e-05,
            -6.510394953932376e-05,
            -6.276281851581309e-05,
            -6.238075158390974e-05,
            -6.115772476218725e-05,
            5.6571648540847196e-05,
            -5.437429718387147e-05,
            5.2608151141550794e-05,
            -4.9387489186617104e-05,
            -4.535001054262407e-05,
            -3.5294796730194444e-05,
            3.3231182784650765e-05,
            3.3092839835045726e-05,
            -2.7216723063920026e-05,
            2.2832619871337003e-05,
            -2.2685503720605412e-05,
            -2.1680433115689105e-05,
            1.7573283934658472e-05,
            -1.4914436145686508e-05,
            1.4480964603022087e-05,
            -1.0431216086190325e-05,
            -8.510907863481366e-06,
            -8.414490231988704e-06,
            -8.269174133583192e-06,
            -7.843168293277401e-06,
            -7.763907956491582e-06,
            -5.123495943392696e-06,
            -4.715617358091509e-06,
            3.7004830057168847e-06,
            3.279792881576732e-06,
            3.148407263767112e-06,
            -3.093787896738916e-06,
            2.5867208561961614e-06,
            -2.1147338579469567e-06,
            -2.0052423587605153e-06,
            -1.9941489306262288e-06,
            1.3578931705750536e-06,
            -1.1679114930296152e-06,
            8.766459434457306e-07,
            4.883247418841837e-07,
            -4.3668486639781616e-07
        ],
        "Absolute Coefficient": [
            0.04063361658747972,
            0.03632617719734872,
            0.03253253490709118,
            0.029380264398378278,
            0.02096947427309031,
            0.015302356508187042,
            0.014473224988142902,
            0.013936381704937358,
            0.01376683037821863,
            0.01252518408692314,
            0.01074728144405196,
            0.010570100200467154,
            0.008252253147081041,
            0.007146444997889308,
            0.005898609307001265,
            0.005262864097712103,
            0.005196940991834039,
            0.004730050856801794,
            0.00417497481865304,
            0.003807834502255212,
            0.003747511066210227,
            0.003663927855925939,
            0.003339933712404097,
            0.0031458985818258816,
            0.0031176622411828252,
            0.0031100761971409765,
            0.0030513382444884106,
            0.002694468905744383,
            0.00254580468002691,
            0.002457363381028319,
            0.0023283308493091646,
            0.002304559369889791,
            0.002282193239543391,
            0.0022279559440443815,
            0.0022220818392139907,
            0.0020882352325817593,
            0.0019071978219685766,
            0.0016939621188588802,
            0.001678669588302927,
            0.0016639015189495432,
            0.0016571345608441745,
            0.0015887963909329164,
            0.0015579603916322147,
            0.0014425106437138298,
            0.001413943255206709,
            0.0014105406412919757,
            0.0013372732995787441,
            0.0012863124997891384,
            0.0012717047360035938,
            0.001252117566338581,
            0.0012301933984221866,
            0.0011563008105640587,
            0.0011547885215365216,
            0.0011444847012146045,
            0.0011398064065694586,
            0.0011094719070950806,
            0.0010925692521917695,
            0.0010541292188055293,
            0.0010495226940098533,
            0.0010380265187559866,
            0.0010362734615916428,
            0.0009859844953656032,
            0.0009835950297488057,
            0.000972783613520484,
            0.0009725736218744327,
            0.0009469420837332525,
            0.0009266309676768962,
            0.0009143631163060883,
            0.0009096637781743605,
            0.0008932332880763542,
            0.0008645277075977668,
            0.0008610038257558869,
            0.0008508761771640148,
            0.0008471194896094227,
            0.0008391294833176689,
            0.0008271808210862831,
            0.0008267313850033544,
            0.0008199610545344981,
            0.0008155223799991696,
            0.0007607627838779005,
            0.0007506805628974934,
            0.0007278533916516125,
            0.0007239779673456682,
            0.0007074709478877227,
            0.0007010596195059898,
            0.0006971695194447078,
            0.0006958850559545754,
            0.0006856844082252355,
            0.0006817343616830612,
            0.000681415497160878,
            0.0006632752043798367,
            0.0006220812171649354,
            0.0005974417422505228,
            0.0005959176609887032,
            0.000595452581837117,
            0.0005947491003239396,
            0.0005896888535763898,
            0.0005868089000319379,
            0.000575982698270285,
            0.0005487617811156098,
            0.0005437564026530849,
            0.0005395323499082296,
            0.0005022712185941551,
            0.0004962833958290652,
            0.0004897920913177036,
            0.0004578373319884706,
            0.0004375349760472477,
            0.0004298165997676344,
            0.0004268735295527226,
            0.00041372255031712525,
            0.000408762315885739,
            0.00039858726492126694,
            0.0003963680704346096,
            0.0003755708555202826,
            0.0003747232285797829,
            0.00034144645544862025,
            0.0003327497495392166,
            0.0003193558686950745,
            0.0003191779004841817,
            0.00031134671688545274,
            0.00031117296344586613,
            0.0003096961422832338,
            0.0003059687436125551,
            0.0003053309989066917,
            0.00029918311947697043,
            0.00029554904507768576,
            0.00029146134926082574,
            0.0002878168133366439,
            0.00028505618435281833,
            0.0002833198251276058,
            0.00028183875016488585,
            0.0002679194122824961,
            0.00025869826467203876,
            0.00025544011496608776,
            0.00025497415911349526,
            0.00022455972414685935,
            0.0002237578137000742,
            0.00021509043106461565,
            0.00021176868606978422,
            0.00021139202561835057,
            0.00020546793705966438,
            0.00020402315262593398,
            0.00019040678133015615,
            0.00018575776279132575,
            0.00018332845225946246,
            0.0001758028478328809,
            0.00017065088693382548,
            0.0001694643196021586,
            0.000166196989397431,
            0.00016285653387203744,
            0.00015376749414355699,
            0.0001531538811221743,
            0.00014835714488676746,
            0.00014714550666417592,
            0.00014235699235983943,
            0.0001397089248699129,
            0.00013736785339812113,
            0.00012395971223030778,
            0.00012330775569945878,
            0.00011562137653111245,
            0.00010658128167952534,
            0.00010388628269377861,
            9.673473659360305e-05,
            9.325018210691285e-05,
            9.233001650073214e-05,
            8.385411551081947e-05,
            8.05378744293964e-05,
            7.992337169121352e-05,
            7.85296195273548e-05,
            7.547349951598908e-05,
            6.640654164327383e-05,
            6.510394953932376e-05,
            6.276281851581309e-05,
            6.238075158390974e-05,
            6.115772476218725e-05,
            5.6571648540847196e-05,
            5.437429718387147e-05,
            5.2608151141550794e-05,
            4.9387489186617104e-05,
            4.535001054262407e-05,
            3.5294796730194444e-05,
            3.3231182784650765e-05,
            3.3092839835045726e-05,
            2.7216723063920026e-05,
            2.2832619871337003e-05,
            2.2685503720605412e-05,
            2.1680433115689105e-05,
            1.7573283934658472e-05,
            1.4914436145686508e-05,
            1.4480964603022087e-05,
            1.0431216086190325e-05,
            8.510907863481366e-06,
            8.414490231988704e-06,
            8.269174133583192e-06,
            7.843168293277401e-06,
            7.763907956491582e-06,
            5.123495943392696e-06,
            4.715617358091509e-06,
            3.7004830057168847e-06,
            3.279792881576732e-06,
            3.148407263767112e-06,
            3.093787896738916e-06,
            2.5867208561961614e-06,
            2.1147338579469567e-06,
            2.0052423587605153e-06,
            1.9941489306262288e-06,
            1.3578931705750536e-06,
            1.1679114930296152e-06,
            8.766459434457306e-07,
            4.883247418841837e-07,
            4.3668486639781616e-07
        ]
    },
    "cv_performance": {
        "prediction": {
            "accuracy": 99.1304347826087,
            "precision": 80.0,
            "recall": 70.0,
            "f1": 73.33333333333333
        },
        "selection": {
            "precision": 0.136986301369863,
            "recall": 2.8571428571428568,
            "f1": 0.26143790849673204,
            "jaccard": 0.13157894736842105
        }
    }
}