Pubmed models
Collection
Embedding and Reranker models trained on the Turkish Pubmed 10K
•
3 items
•
Updated
This is a Cross Encoder model finetuned from Alibaba-NLP/gte-multilingual-reranker-base using the sentence-transformers library. It computes scores for pairs of texts, which can be used for text reranking and semantic search.
First install the Sentence Transformers library:
pip install -U sentence-transformers
Then you can load this model and run inference.
from sentence_transformers import CrossEncoder
# Download from the 🤗 Hub
model = CrossEncoder("SMARTICT/gte-multilingual-reranker-base-pubmed-tr-v1")
# Get scores for pairs of texts
pairs = [
['Yaşlanmakta olan erkeklerde testosteron seviyelerindeki değişiklikler nasıl gözlemlenir ve bu değişiklikler hangi hormon seviyeleriyle ilişkilidir?', 'Testosteron seviyeleri azalır ve bu azalma, gonadotropinlere zayıf yanıt vermeyle birlikte görülür; testosteron seviyelerindeki düşüş, LH seviyelerinde artışla takip edilir.'],
['Yaşlanmakta olan erkeklerde testosteron seviyelerindeki değişiklikler nasıl gözlemlenir ve bu değişiklikler hangi hormon seviyeleriyle ilişkilidir?', 'Testosteron, NE seviyelerini, alımını veya salınımını etkilemediği gibi, vas deferens ve epididimste tirosin hidroksilaz aktivitesini değiştirmedi.'],
['Yaşlanmakta olan erkeklerde testosteron seviyelerindeki değişiklikler nasıl gözlemlenir ve bu değişiklikler hangi hormon seviyeleriyle ilişkilidir?', 'Yavaş dalga uykusundaki azalma, hormon seviyelerinde belirgin bir değişiklikle eşleşmedi.'],
['Yaşlanmakta olan erkeklerde testosteron seviyelerindeki değişiklikler nasıl gözlemlenir ve bu değişiklikler hangi hormon seviyeleriyle ilişkilidir?', 'Serum testosteron, diyaliz edilebilir testosteron ve LH seviyeleri sağlıklı erkeklerle anlamlı derecede fark göstermemekte, sadece LH yanıtları biraz daha yüksek bulunmuştur.'],
['Yaşlanmakta olan erkeklerde testosteron seviyelerindeki değişiklikler nasıl gözlemlenir ve bu değişiklikler hangi hormon seviyeleriyle ilişkilidir?', 'Maksimum uyarım testiyle değerlendirildi ve 6-15 yaş arasındaki erkekler üzerinde yapıldı.'],
]
scores = model.predict(pairs)
print(scores.shape)
# (5,)
# Or rank different texts based on similarity to a single text
ranks = model.rank(
'Yaşlanmakta olan erkeklerde testosteron seviyelerindeki değişiklikler nasıl gözlemlenir ve bu değişiklikler hangi hormon seviyeleriyle ilişkilidir?',
[
'Testosteron seviyeleri azalır ve bu azalma, gonadotropinlere zayıf yanıt vermeyle birlikte görülür; testosteron seviyelerindeki düşüş, LH seviyelerinde artışla takip edilir.',
'Testosteron, NE seviyelerini, alımını veya salınımını etkilemediği gibi, vas deferens ve epididimste tirosin hidroksilaz aktivitesini değiştirmedi.',
'Yavaş dalga uykusundaki azalma, hormon seviyelerinde belirgin bir değişiklikle eşleşmedi.',
'Serum testosteron, diyaliz edilebilir testosteron ve LH seviyeleri sağlıklı erkeklerle anlamlı derecede fark göstermemekte, sadece LH yanıtları biraz daha yüksek bulunmuştur.',
'Maksimum uyarım testiyle değerlendirildi ve 6-15 yaş arasındaki erkekler üzerinde yapıldı.',
]
)
# [{'corpus_id': ..., 'score': ...}, {'corpus_id': ..., 'score': ...}, ...]
question
, answer
, and label
question | answer | label | |
---|---|---|---|
type | string | string | int |
details |
|
|
|
question | answer | label |
---|---|---|
Yaşlanmakta olan erkeklerde testosteron seviyelerindeki değişiklikler nasıl gözlemlenir ve bu değişiklikler hangi hormon seviyeleriyle ilişkilidir? |
Testosteron seviyeleri azalır ve bu azalma, gonadotropinlere zayıf yanıt vermeyle birlikte görülür; testosteron seviyelerindeki düşüş, LH seviyelerinde artışla takip edilir. |
1 |
Yaşlanmakta olan erkeklerde testosteron seviyelerindeki değişiklikler nasıl gözlemlenir ve bu değişiklikler hangi hormon seviyeleriyle ilişkilidir? |
Testosteron, NE seviyelerini, alımını veya salınımını etkilemediği gibi, vas deferens ve epididimste tirosin hidroksilaz aktivitesini değiştirmedi. |
0 |
Yaşlanmakta olan erkeklerde testosteron seviyelerindeki değişiklikler nasıl gözlemlenir ve bu değişiklikler hangi hormon seviyeleriyle ilişkilidir? |
Yavaş dalga uykusundaki azalma, hormon seviyelerinde belirgin bir değişiklikle eşleşmedi. |
0 |
BinaryCrossEntropyLoss
with these parameters:{
"activation_fn": "torch.nn.modules.linear.Identity",
"pos_weight": 5
}
eval_strategy
: stepsper_device_train_batch_size
: 16per_device_eval_batch_size
: 16learning_rate
: 2e-05num_train_epochs
: 2warmup_ratio
: 0.1bf16
: Truedataloader_num_workers
: 4load_best_model_at_end
: Trueoverwrite_output_dir
: Falsedo_predict
: Falseeval_strategy
: stepsprediction_loss_only
: Trueper_device_train_batch_size
: 16per_device_eval_batch_size
: 16per_gpu_train_batch_size
: Noneper_gpu_eval_batch_size
: Nonegradient_accumulation_steps
: 1eval_accumulation_steps
: Nonetorch_empty_cache_steps
: Nonelearning_rate
: 2e-05weight_decay
: 0.0adam_beta1
: 0.9adam_beta2
: 0.999adam_epsilon
: 1e-08max_grad_norm
: 1.0num_train_epochs
: 2max_steps
: -1lr_scheduler_type
: linearlr_scheduler_kwargs
: {}warmup_ratio
: 0.1warmup_steps
: 0log_level
: passivelog_level_replica
: warninglog_on_each_node
: Truelogging_nan_inf_filter
: Truesave_safetensors
: Truesave_on_each_node
: Falsesave_only_model
: Falserestore_callback_states_from_checkpoint
: Falseno_cuda
: Falseuse_cpu
: Falseuse_mps_device
: Falseseed
: 42data_seed
: Nonejit_mode_eval
: Falseuse_ipex
: Falsebf16
: Truefp16
: Falsefp16_opt_level
: O1half_precision_backend
: autobf16_full_eval
: Falsefp16_full_eval
: Falsetf32
: Nonelocal_rank
: 0ddp_backend
: Nonetpu_num_cores
: Nonetpu_metrics_debug
: Falsedebug
: []dataloader_drop_last
: Falsedataloader_num_workers
: 4dataloader_prefetch_factor
: Nonepast_index
: -1disable_tqdm
: Falseremove_unused_columns
: Truelabel_names
: Noneload_best_model_at_end
: Trueignore_data_skip
: Falsefsdp
: []fsdp_min_num_params
: 0fsdp_config
: {'min_num_params': 0, 'xla': False, 'xla_fsdp_v2': False, 'xla_fsdp_grad_ckpt': False}fsdp_transformer_layer_cls_to_wrap
: Noneaccelerator_config
: {'split_batches': False, 'dispatch_batches': None, 'even_batches': True, 'use_seedable_sampler': True, 'non_blocking': False, 'gradient_accumulation_kwargs': None}deepspeed
: Nonelabel_smoothing_factor
: 0.0optim
: adamw_torchoptim_args
: Noneadafactor
: Falsegroup_by_length
: Falselength_column_name
: lengthddp_find_unused_parameters
: Noneddp_bucket_cap_mb
: Noneddp_broadcast_buffers
: Falsedataloader_pin_memory
: Truedataloader_persistent_workers
: Falseskip_memory_metrics
: Trueuse_legacy_prediction_loop
: Falsepush_to_hub
: Falseresume_from_checkpoint
: Nonehub_model_id
: Nonehub_strategy
: every_savehub_private_repo
: Nonehub_always_push
: Falsehub_revision
: Nonegradient_checkpointing
: Falsegradient_checkpointing_kwargs
: Noneinclude_inputs_for_metrics
: Falseinclude_for_metrics
: []eval_do_concat_batches
: Truefp16_backend
: autopush_to_hub_model_id
: Nonepush_to_hub_organization
: Nonemp_parameters
: auto_find_batch_size
: Falsefull_determinism
: Falsetorchdynamo
: Noneray_scope
: lastddp_timeout
: 1800torch_compile
: Falsetorch_compile_backend
: Nonetorch_compile_mode
: Noneinclude_tokens_per_second
: Falseinclude_num_input_tokens_seen
: Falseneftune_noise_alpha
: Noneoptim_target_modules
: Nonebatch_eval_metrics
: Falseeval_on_start
: Falseuse_liger_kernel
: Falseliger_kernel_config
: Noneeval_use_gather_object
: Falseaverage_tokens_across_devices
: Falseprompts
: Nonebatch_sampler
: batch_samplermulti_dataset_batch_sampler
: proportionalrouter_mapping
: {}learning_rate_mapping
: {}Epoch | Step | Training Loss |
---|---|---|
0.0006 | 1 | 0.8636 |
0.6131 | 1000 | 0.632 |
1.2262 | 2000 | 0.42 |
1.8394 | 3000 | 0.3123 |
@inproceedings{reimers-2019-sentence-bert,
title = "Sentence-BERT: Sentence Embeddings using Siamese BERT-Networks",
author = "Reimers, Nils and Gurevych, Iryna",
booktitle = "Proceedings of the 2019 Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing",
month = "11",
year = "2019",
publisher = "Association for Computational Linguistics",
url = "https://arxiv.org/abs/1908.10084",
}
Base model
Alibaba-NLP/gte-multilingual-reranker-base