Dataset Viewer
sentence1
stringlengths 67
415
| sentence2
stringlengths 44
362
| score
float64 0
4
|
|---|---|---|
Недавно было показано, что Craf необходим для развития индуцированного Kras G12D NSCLC. | Недавно стало очевидным, что Craf необходим для развития Kras-обусловленного немелкоклеточного рака лёгкого. | 4 |
Ингибитор Bcl-2 ABT-737 вызывает регрессию солидных опухолей, и его производные находятся на ранней клинической стадии в качестве противоопухолевых средств; однако он воздействует на Bcl-2, Bcl-XL и Bcl-w, но не на Mcl-1, что обусловливает резистентность к апоптотической гибели клеток, индуцированной ABT-737. | Недавно было сообщено, что ABT-737 не проявляет цитотоксичности в отношении всех опухолевых клеток, а резистентность к химиотерапии с использованием ABT-737 зависит от значительного уровня экспрессии Mcl-1 — единственного представителя семейства Bcl-2, который данный препарат не ингибирует эффективно. | 3 |
Предыдущие исследования показали, что снижение уровня 5 hmC в опухолях было обусловлено уменьшением экспрессии генов TET1/2/3 и IDH2 или опухолевыми мутациями IDH1 и IDH2. | Кроме того, генетические и функциональные исследования позволяют предположить, что неоморфные мутации IDH способствуют миелоидной трансформации, по крайней мере частично, за счет ингибирования ферментативной функции TET. | 2.2 |
В недавних исследованиях было показано, что мутации IDH и связанное с ними образование 2-гидроксиглутарата (2HG) в лейкозных клетках индуцируют глобальное гиперметилирование ДНК за счет нарушения каталитической функции TET2. | Недавно также было сообщено, что мутации генов изоцитратдегидрогеназ IDH1 и IDH2 могут приводить к аномальному синтезу 2-гидроксиглутарата (2-HG) — метаболита, ингибирующего ферментативную активность TET2, что вызывает гиперметилированный промоторный фенотип в опухолях острого миелоидного лейкоза (AML) с мутациями IDH1/2. | 3.2 |
Недавние исследования in vitro с использованием методов на основе shRNA продемонстрировали роль TET2 в регуляции миелоидной дифференцировки и контроле пролиферации стволовых/прогениторных клеток. | В двух недавних исследованиях с использованием опосредованного RNAi подавления экспрессии Tet2 in vitro было показано, что дефицит TET2 приводит к нарушению гемопоэтической дифференцировки и преимущественной миелоидной направленности клеток. | 3.2 |
Недавно было показано, что экспрессия IDH1R132H подавляет активность TET2, а мутации генов IDH1 и IDH2 возникают во взаимно исключающем характере с мутациями гена TET2 при AML. | Данное масштабное исследование показало, что мутации IDH1/IDH2 являются взаимоисключающими с инактивирующими мутациями TET2, что указывает на схожее функциональное воздействие обоих типов мутаций и, следовательно, их избыточность в механизме развития заболевания. | 3.2 |
Недавно было сообщено, что экспрессия IDH1R132H подавляет активность TET2, а мутации генов IDH1 и IDH2 встречаются взаимно исключительно с мутациями гена TET2 при AML. | Механизм был выяснен в ходе еще одного геномного исследования, на этот раз с участием острого миелоидного лейкоза (AML). | 1.4 |
Экспрессия активированной формы белков Ras может индуцировать сенесценцию в некоторых первичных фибробластах. | Однако при экспрессии в первичных клетках онкогенный Ras индуцирует преждевременное старение — предполагаемый механизм подавления опухолевого роста, защищающий от неконтролируемой пролиферации. | 3 |
Высокий процент опухолевых клеток, приобретающих бессмертные характеристики, демонстрирует активность теломеразы, и предполагается, что экспрессия hTERT может быть одним из шести ключевых событий, общих для рака. | В качестве серин/треониновой протеинкиназы AKT осуществляет свои функции путем фосфорилирования ключевых промежуточных сигнальных молекул, что приводит к усилению клеточного метаболизма, росту, выживанию и инвазивности клеток — всем характерным признакам онкологических заболеваний. | 1.4 |
Учитывая данные о том, что многие опухоли, встречающиеся в естественных условиях, возникают в результате отбора клеток с генетическими и/или эпигенетическими изменениями. | Феномен развития неоплазий и неопластической трансформации, возникающий in vivo или in vitro, рассматривается как результат накопления серии генетических и эпигенетических изменений, нарушающих нормальные процессы клеточного деления и тканевой целостности. | 3 |
Феномены неопластического развития и неопластической трансформации, возникающие in vivo или in vitro, рассматриваются как результат накопления серии генетических и эпигенетических изменений, нарушающих нормальные процессы клеточного деления и целостности тканей. | Неопластическое развитие представляет собой кумулятивные генетические и эпигенетические изменения, приводящие к появлению клеток, способных приобретать опухолегенный фенотип. | 3 |
Опухолегенез представляет собой многостадийный процесс, вовлекающий различные типы клеток. | Предыдущие исследования позволили выявить ряд ключевых функций, необходимых для возникновения злокачественного новообразования, что обеспечивает логичный научно обоснованный подход к пониманию сложности процессов опухолевой прогрессии. | 1 |
Кроме того, транзиентно экспрессируемый экзогенный LATS2 локализуется в центросомах. | LATS1 и LATS2 обнаружены на интерфазных и митотических центросомах | 3 |
Поскольку у S. cerevisiae было показано, что DBF2 ассоциирован с прогрессией анафазы и/или телофазы, мы исследовали, влияет ли делеция этой киназы на прогрессирование клеточного цикла у N. crassa. | Учитывая роль, которую, как было показано, играют гомологи DBF2 в прогрессии клеточного цикла, ожидается преимущественная локализация DBF-2 у N. crassa. | 2 |
Несколько вычислительных методов прогнозирования мишеней, таких как TargetScan, PicTar, miRanda, PITA, DIANA-microT и RNAhybrid, были разработаны для предсказания генов-мишеней. | Три программы, PicTar, miRanda и TargetScan, были использованы для прогнозирования мишеней miR-21. | 2.4 |
Ряд доказательств свидетельствует о том, что известные основные нарушения пути RB в опухолях человека проявляют взаимную исключительность. | В отдельных образцах человеческих опухолей сообщается, что основные компоненты данного пути — RB-CDK4/6-p16INK4A — подвергаются воздействию во взаимно исключающем режиме. | 3.4 |
Белок ретинобластомы, pRb, был одним из первых идентифицированных супрессорных белков опухолей, а утрата или подавление функции pRb, как считается, играет причинную роль в большинстве случаев рака у человека. | Мутация гена предрасположенности к ретинобластоме RB1 является лимитирующей стадией в развитии ретинобластомы, при этом более 90% опухолей человека демонстрируют снижение функции pRB. | 3 |
Например, потеря или функциональные изменения двух основных белков-супрессоров опухолей, pRB и p53, приводят к усилению биогенеза рибосом в раковых тканях. | E2F1 стабилизирует p53 путем индукции экспрессии p19(p14)/ARF — ингибитора убиквитинлигазы mdm2, которая направляет p53 на протеолиз. | 2 |
Недавно miR-126 была идентифицирована как miRNA, подавляющая метастазирование, экспрессия которой снижена при рецидивирующем раке молочной железы, лейкозе и раке шейки матки. | Последующие исследования показали, что miR-126 таргетирует онкоген IRS-1 (insulin receptor substrate-1) в клетках рака молочной железы, а также продемонстрировали снижение экспрессии miR-126 при раке шейки матки. | 3.2 |
Недавно miR-126 была идентифицирована как miRNA, подавляющая метастазирование, экспрессия которой снижена при рецидивирующем раке молочной железы, лейкемии и раке шейки матки. | MiR-155 гиперэкспрессируется при различных злокачественных новообразованиях человека, включая хронический лимфоцитарный лейкоз, меланому, плоскоклеточный рак головы и шеи, светлоклеточный рак почки, гепатоцеллюлярную карциному, лимфому, карциному щитовидной железы, рак молочной железы, колоректальный рак, рак шейки матки, рак поджелудочной железы и рак легких. | 2 |
Повышение регуляции miR-24 наблюдается при ряде злокачественных новообразований, включая OSCC. | Кроме того, miR-24 является одной из наиболее распространенных miRNA в клетках рака шейки матки и, согласно данным, повышенно регулируется при солидных раках желудка. | 3 |
MiR-223, по-видимому, является мишенью для TF, регулирующих гранулопоэз. | Петли обратной связи, в которых транскрипционный фактор, регулируемый miRNA, контролирует транскрипцию соответствующей ему miRNA, были описаны у ряда животных. | 1.2 |
Более того, в недавнем исследовании был продемонстрирован механизм, определяющий миелоидную экспрессию miR-223, и предложена уникальная «миниконтурная система», состоящая из miR-223 и транскрипционных факторов NFI-A и CAAT-связывающего белка α (C/EBPα). | miR-223 регулирует гранулопоэз посредством механизма обратной связи и конкурентно модулируется транскрипционными факторами ядерным фактором I/A (NFI-A) и CCAAT/энхансер-связывающим белком-α (C/EBPα). | 3.4 |
miR-223 регулирует гранулопоэз посредством механизма обратной связи и конкурентно модулируется транскрипционными факторами ядерный фактор I/A (NFI-A) и CCAAT/энхансер-связывающий белок-α (C/EBPα) | Поступает все больше данных из исследований на животных моделях, что регулируемые miRNA факторы транскрипции часто контролируют транскрипцию своих собственных miRNA. | 1.8 |
В миелопоэзе показано, что miR-223 регулирует развитие гранулоцитов как у людей, так и у мышей. | Как было показано ранее, miR-223 высоко консервативен, а его миелоид-специфичная экспрессия также хорошо охарактеризована как у человека, так и у мыши. | 3.6 |
Чтобы уточнить роль микроРНК в эритропоэзе, были выбраны четыре микроРНК (miR-155, miR-221, miR-223 и miR-451), поскольку их экспрессия, по-видимому, связана с гемопоэзом. | В миелопоэзе miR-223 регулирует развитие гранулоцитов как у людей, так и у мышей. | 2 |
Затем мы предприняли попытку повторно оценить регуляцию miR-223 в точно такой же экспериментальной системе, которая использовалась в предыдущей работе. | Важно отметить, что повторный анализ показал, что данный консервативный промотор, вероятно, активен в индукции miR-223 в процессе дифференцировки клеточной линии APL NB4, индуцированной All-trans ретиноевой кислотой (ATRA), которая является основной экспериментальной системой, использованной в предыдущем исследовании. | 2.4 |
Уникальные участки гомологичных последовательностей в RIP1 и RIP3 (RIP гомотипические мотивы взаимодействия, RHIMs) были показаны опосредующими их взаимодействие. | Сообщалось, что RIP1 взаимодействует с RIP3. | 3.4 |
Данная форма некроза, также называемая некроптозом, требует активности рецептор-взаимодействующей протеинкиназы 1 (RIP1) и родственной ей киназы RIP3. | Опосредованный TNF запрограммированный некроз обычно включает рецептор-взаимодействующие серин-треониновые киназы 1 и 3 (RIP1 и RIP3), что подтверждено на клеточных линиях человека, мыши и рыбки данио, а также в мышиной модели сепсиса. | 3 |
Данная форма некроза, также называемая некроптозом, требует активности рецептор-взаимодействующей протеинкиназы 1 (RIP1) и родственной ей киназы RIP3. | Кроме того, другие исследования также показали, что некроптоз может индуцироваться посредством модуляции RIP1 и RIP3. | 4 |
Кроме того, нокаутирование обоих Erk1 и Erk2 нарушало развитие опухоли, тогда как инактивация каждого из них по отдельности не оказывала эффекта. | Только одновременная абляция ERK1 и ERK2 нарушает рост опухоли. | 4 |
Важно отметить, что роль фосфорилирования ERK в NSCLC, вызванных мутацией Kras, недавно была подчеркнута демонстрацией того, что активность ERK необходима для опухолегенеза легких, вызванного мутацией Kras. | Как упоминалось выше, высокая активность ERK критически важна для развития Kras-ассоциированных НМРЛ. | 3.4 |
Формирование опухолей легких у мышей под действием онкогенного KRAS требует участия CRaf, но не BRaf. | Онкогенная активность мутантного Kras, по-видимому, зависит от функционального Craf, но не от Braf. | 3.4 |
Онкогенная активность мутантного Kras, по-видимому, зависит от функционального Craf, но не от Braf. | Примечательно, что c-Raf недавно был признан необходимым для развития K-Ras-driven NSCLC. | 3 |
Онкогенная активность мутантного Kras оказывается зависимой от функционального Craf. | Онкогенные мутации KRAS часто встречаются при раковых заболеваниях. | 2 |
Субъединицы BAF53 и β-актина участвуют в регулируемом SWI/SNF связывании с хроматином/ядерным матриксом у млекопитающих. | Кроме того, Arp4-родственный белок BAF53 и β-актин являются компонентами комплекса SWI/SNF человека и могут играть роль в его регулируемой сигналами связи с хроматином/ядерным матриксом. | 3.8 |
Млекопитающие Arp, BAF53 (фактор, ассоциированный с BRG) и β-актин изначально были обнаружены в составе BAF-ремоделирующего хроматинового комплекса SWI/SNF-типа у млекопитающих. | Кроме того, Arp4-родственный BAF53 и β-актин входят в состав человеческого SWI/SNF комплекса и могут участвовать в его регулируемом сигналами связывании с хроматином/ядерным матриксом. | 3.4 |
Все известные GEFs реконфигурируют нуклеотид-связывающий карман, часто раскрывая его за счет перестройки переключающих участков. | Характерной особенностью GEFs является их выраженное предпочтение связывания с нуклеотид-свободными GTPазами по сравнению с GTPазами, связанными с нуклеотидом. | 2 |
В эукариотических клетках малые G-белки критически регулируются гуаниновыми нуклеотид-обменными факторами (GEFs) и активирующими GTPазу белками (GAPs). | Эукариотические малые G-белки часто регулируются за счет балансирующего действия GAPs и GEFs. | 4 |
В предыдущем исследовании на мышиной модели KRas-зависимой аденокарциномы протока поджелудочной железы было показано, что онкогенный KRas индуцирует биосинтез нуклеотидов преимущественно за счет усиления неокислительной ветви ППП. | Предыдущие результаты показали, что онкогенный Ras повышает синтез рибонуклеотидов преимущественно через неокислительную ветвь PPP. | 3.2 |
Важно отметить, что подавление экспрессии Gfpt1 с помощью RNAi снизило общий уровень O-GlcNAцилирования и блокировало опосредованный KrasG12DA рост опухолей in vitro и in vivo. | GFPT1 является лимитирующим скорость ферментом в пути HBP и был идентифицирован как важный фактор развития Kras-опосредованной протоковой аденокарциномы поджелудочной железы (PDAC) | 2.2 |
Мы и другие исследователи недавно описали индуцибельную модель рака поджелудочной железы iKras*p53+/−, которая позволяет осуществлять тканеспецифичную, индуцибельную и обратимую экспрессию мутантного Kras в комбинации с потерей функционального аллеля супрессора опухолей p53. | Существует определенная вариабельность в данных результатах: например, метастатический потенциал был описан другими исследовательскими группами с использованием мышей KC или iKras* в сочетании с аллелью потери функции p53. | 3 |
Общая точность нашего классификатора экспрессии генов составила ~88%, при этом все случаи T-ALL, TEL-AML1-позитивных, гипердиплоидных и E2A-реарранжированных лейкозов были правильно классифицированы (т.е. чувствительность 100%), что согласуется с данными, ранее полученными при использовании других стратегий отбора пробных наборов и построения классификаторов. | Геном, заслуживающим дальнейших исследований, является рецептор эритропоэтина, экспрессия которого в 7,4 раза выше в случаях TEL-AML1-позитивного лейкоза по сравнению с другими вариантами прекурсорного B-ALL, что подтверждает результаты других исследований по классификации генной экспрессии. | 2 |
Геном, который требует дальнейшего изучения, является рецептор эритропоэтина, экспрессия которого в 7,4 раза выше в случаях TEL-AML1-позитивного лейкоза по сравнению с другими вариантами прекурсорного B-ALL, что подтверждает данные других исследований по классификации генной экспрессии. | Еще одно недавнее исследование экспрессии генов, проведенное на большом числе случаев, подтвердило гипотезу о том, что различные лейкозы определяются каждой из уникальных хромосомных аномалий, обнаруженных при лимфобластных лейкозах. | 0.6 |
Клетки, трансформированные MLL-FKBP и MLL-AF9, демонстрировали стабильную экспрессию Hox a7 и Hox a9, а также кофактора Hox Meis 1. | Независимо от механизма активации транскрипции, всё больше данных свидетельствует о том, что Hox a7, Hox a9 и Meis1 являются ключевыми мишенями для опосредованной MLL химерными белками трансформации. | 3.2 |
Данные результаты полностью соответствовали картине экспрессии, наблюдаемой при острых лимфоидных и миелоидных лейкемиях с MLL-перестройками у человека. | Данные гены стабильно экспрессируются при лейкозах с перестройками MLL. | 3.6 |
Конструкты miR-Vec были описаны ранее, а открытые рамки считывания Dnd1 клонировали, как указано, в экспрессионный вектор CMV на основе pCS2 для включения двойного карбокси-концевого HA-тега. | Плазмиды pMSCV-blast-miR, содержащие либо человеческую miRNA hsa-miR-376a1, либо контрольную miRNA (hTR — РНК теломеразы человека), были сконструированы, как описано ранее. | 1 |
Для репрессии Sox11 с помощью miR-204 клетки Neuro-2a (ATCC) культивировали на покровных стеклах в 24-луночных планшетах в течение 24 ч, после чего проводили совместную трансфекцию 500 нг плазмиды экспрессии pCAG-GFP и 500 нг плазмиды экспрессии scrambled-miRVec или miR-204-miRVec, содержащей пре-миРНК miR-204. | Ко-трансфекция miRVec-miR-204 и плазмиды Renilla-3′ UTR проводилась в клетках HEK293T с использованием трансфекционного реагента TransIT-LT1 (Mirus) | 1.8 |
Следовательно, было показано, что микроРНК могут действовать либо как онкогены (например, miR-155, miR-17−5p и miR-21), либо как супрессоры опухолей (например, miR-34, miR-15a, miR-16−1 и let-7). | Степень, в которой miRNAs специфически влияют на метастазирование, остается неясной, поскольку все описанные miRNAs, воздействующие на метастазирование, также оказывают потенциально искажающие эффекты на развитие первичной опухоли, апоптоз и/или пролиферацию клеток. | 2.8 |
Следовательно, было показано, что miRNA могут выступать в качестве онкогенов (например, miR-155, miR-17−5p и miR-21) или супрессоров опухолей (например, miR-34, miR-15a, miR-16−1 и let-7). | Учитывая значительную вовлеченность miRNA в физиологические процессы, дисрегуляция их экспрессии может быть связана с патобиологией рака, включая онкогенез, пролиферацию, эпителиально-мезенхимальный переход, метастазирование, нарушения метаболизма и ангиогенез, среди прочего. | 2.8 |
Во многих опухолях наблюдается либо сверхэкспрессия так называемых онкогенных miRNA (например, miR-155, miR-17−5p и miR-21), либо снижение регуляции опухолесупрессорных miRNA (например, miR-34, miR-15a, miR-16−1 и let-7). | miR-373 ранее был идентифицирован как потенциальный онкоген (вместе с miR-372) при герминогенных опухолях яичка, хотя было предположено, что прометастатические и онкогенные свойства этой miRNA обусловлены регуляцией различных генов (CD44 и LATS2, соответственно). | 1.8 |
Для непосредственного измерения влияния эндогенного Dnd1 на активность эндогенного семейства miR-372 мы использовали сенсорные молекулы, содержащие ген люциферазы под контролем либо нативной LATS2-3′UTR, либо ее мутантной версии с измененными сайтами связывания miR-372. | 3′UTR p27 и коннексина-43 были амплифицированы методом PCR из геномной ДНК и клонированы в pGL3 (Promega) ниже гена люциферазы; конструкции, содержащие 3′UTR LATS2, были описаны ранее. | 1.8 |
Эти модели способствовали идентификации кандидатных онкогенов и генов-супрессоров опухолей. | Разработка геномных библиотек реагентов RNAi позволила реализовать подходы с потерей функции в клетках млекопитающих, что привело к идентификации кандидатных генов-супрессоров опухолей. | 2.6 |
Данные клетки (далее обозначаемые как TLM-HMECs) являются иммортализованными, но не пролиферируют в отсутствие внеклеточного матрикса (ECM). | HMECs, экспрессирующие hTERT и SV40 LT (TLM-HMECs), культивировали в среде для роста маммарных эпителиальных клеток (MEGM, Lonza) | 1.4 |
Как ни парадоксально, недавно было установлено, что Rest выполняет функции как супрессора опухолей, так и онкогена. | REST — это транскрипционный фактор, который репрессирует нейрональные гены в неневральных тканях и играет важную роль супрессора опухолей в эпителиальных тканях. | 3 |
INPP4B был выявлен среди набора RNAi как фактор, индуцирующий анкеронезависимый рост в эпителиальных клетках молочной железы человека (HMEC). | RASA4/CAPRI (RAS p21 protein activator 4), супрессор трансформации эпителиальных клеток, функционирует как Ca²⁺-зависимый GTPаза-активирующий белок (GAP) Ras, инактивирующий путь Ras-MAPK после стимула, вызывающего повышение внутриклеточного кальция. | 0.6 |
Изменения в экспрессии Oct-4 способствуют дифференцировке и приводят к детерминации примитивных прогениторов эктодермального, эндодермального или мезодермального происхождения. | Экспрессия OCT4 и SOX2 влияет на гены ранней дифференцировки, такие как экспрессия SOX-17. | 1.8 |
Клеточные линии T47D, MCF-7, Skbr3, HeLa и Caco-2 были трансфицированы методом электроporации, как было описано ранее. | Клетки MCF7 или HeLa электропорировали, как описано ранее, с эффективностью более 95% с использованием pSuper конструкций, нацеленных на различные мишени, и через 72 ч экспрессию белка анализировали с помощью SDS-PAGE и вестерн-блоттинга. | 3 |
Однако было показано, что убиквитинирование циклина D1 может эффективно происходить после фосфорилирования другого сайта или без явной необходимости фосфорилирования. | APC-зависимая деградация циклина D1 не требует фосфорилирования треонина 286, но зависит от наличия «бокса деградации циклина»; однако, как показало настоящее исследование, фосфорилирование треонина 286 необходимо для протеолитической деградации циклина D1 в коже. | 3 |
В нескольких исследованиях сообщалось о контроле APC/C под действием генотоксического стресса в клетках млекопитающих. Ионизирующее излучение продемонстрировало способность активировать APC/C для деградации циклина D1, что вызывает немедленную остановку клеточного цикла в фазе G1, не зависящую от p53. | Действительно, было показано, что генотоксические стрессы, такие как ионизирующее излучение, индуцируют быстрое разрушение циклина D1 посредством протеолиза, что приводит к p53-независимой остановке клеточного цикла в фазе G1. | 3.8 |
Поскольку p16INK4a блокирует инактивацию pRb циклин-зависимыми киназами, а Arf предотвращает инактивацию p53 посредством Mdm2-опосредованного протеолиза, оба белка способны индуцировать остановку клеточного цикла. | Индуцируя Arf и Ink4a в первичных фибробластах грызунов, экспрессия онкогенного Ras приводит к остановке роста и преждевременному старению. | 2.4 |
Для анализа экспрессии на различных стадиях дифференцировки были получены данные по 43 образцам мышей из базы данных StemBase, полученные в 16 исследованиях с использованием микрочипов Affymetrix MOE430A, аналогично примененным в исследовании профилирования экспрессии Oct4, охватывающем эмбриональные стволовые клетки мыши (ESCs), линии эмбриональных карциномных клеток и несколько ранних дифференцированных линий. | Мы исследовали профили экспрессии набора данных, ассоциированных с Oct4, в клетках на различных стадиях дифференцировки, включая эмбриональную карциному, эмбриональные стволовые клетки, эмбриоидные тельца и различные дифференцированные типы клеток, на основе данных транскриптомики. | 3.6 |
Помимо этих 28 генов, регулируемых OCT4, сеть Oct4-OETN включала еще 8 генов из недавно опубликованного списка транскриптов, ассоциированных с OCT4 и экспрессирующихся в ESCs. | Почти половина (37) генов Oct4-OETN являются известными компаньонами Oct4 в ESCs, поскольку их экспрессия непосредственно регулируется или коррелирует с Oct4. | 2.8 |
Экспрессия активированной формы белков Ras может индуцировать сенесценцию в некоторых первичных фибробластах. | Было установлено, что сенесцентное состояние может индуцироваться в некоторых культивируемых клетках в ответ на высокий уровень экспрессии генов, таких как активированный онкоген ras. | 3.6 |
Активированный Ras трансформирует стабильные клеточные линии, такие как NIH3T3, но вызывает остановку роста, подобную сенесценции, в первичных клетках. | Онкогены, такие как H-RASV12, индуцируют стрессовый ответ в первичных клетках, приводящий к необратимой остановке роста, известной как преждевременное старение. | 3 |
Описанные Oct-4-зависимые транскрипционные сети регулируют самовозобновление и плюрипотентность в эмбриональных стволовых (ES) и эмбриональных карциномных (EC) клетках человека и мыши, а также в мезенхимальных клетках человека. | Ко-трансфекция miRVec-miR-204 и плазмиды Renilla-3′ UTR проводилась в клетках HEK293T с использованием трансфекционного реагента TransIT-LT1 (Mirus) | 0 |
Активность окислительной ветви повышена по сравнению со многими линиями раковых клеток, где окислительная ветвь обычно снижена и составляет <20% потока углерода через ПФП. | Лаборатория Downward прошла весь путь от идентификации GATA2 как нового синтетически летального гена до его валидации с использованием Kras-зависимых GEM-моделей. | 0 |
Экспрессия мутантного K-Ras сама по себе достаточна для инициации злокачественной прогрессии, тогда как элиминация мутантного K-Ras из сформированных опухолей приводит к их регрессии. | Результаты исследования представляют собой очень важный прорыв в многолетней борьбе с раком легких. | 0.2 |
Многочисленные данные свидетельствуют о том, что раковые клетки формируют зависимости от нормальных функций определенных генов, которые потенциально могут быть использованы для совершенствования терапевтических стратегий. | В случае клеточного ответа на стресс циклин D1 может деградировать посредством связывания с анафазопромотирующим комплексом и RXXL-последовательностью, расположенной в NH2-концевой части белка. | 0 |
В клеточной линии PC9 потеря GATA6 и/или HOPX не влияла на рост клеток, тогда как снижение уровня GATA2 и EGFR подавляло жизнеспособность клеток, как сообщалось ранее. | Показано, что активность многих регуляторных факторов контрольных точек утрачивается или блокируется в процессе канцерогенеза. | 0.2 |
Недавнее исследование выявило важность транскрипционной сети GATA2 при NSCLC, ассоциированном с онкогеном RAS, и предложило эффективные комбинации, направленные на ингибирование протеасомы в сочетании с таргетным воздействием на IL-1 и Rho-сигнальные пути. | Анафазопромотирующий комплекс (APC) ответственен за быструю деградацию циклина D1 в клетках, облученных ионизирующим излучением. | 0.2 |
Исследователи провели скрининг линий клеток NSCLC человека, несущих либо дикий тип, либо мутантную форму KRAS, с использованием библиотеки RNAi, направленной против 7000 человеческих генов. | Недавно было показано, что Gata2 выполняет такую роль в индуцированном мутантным Kras NSCLC. | 1.8 |
Ряд исследований выявил универсальные стратегии терапии KRAS-мутантных опухолей с помощью скринингов РНК-интерференции, включая ингибирование TAK1, STK33, TBK1, WT1, GATA2 и BCL-XL/MEK. | Это также позволит использовать ингибиторы, направленные на единичный нормальный белок, от которого особенно зависят опухолевые клетки вследствие мутации в определенном сигнальном пути. | 1.4 |
Исследователи объединили доступные ингибиторы, селективные к двум сигнальным путям, регулируемым GATA2, для лечения мышей с Kras-индуцированными NSCLC. | В клеточной линии PC9 потеря GATA6 и/или HOPX не влияла на рост клеток, тогда как снижение уровня GATA2 и EGFR подавляло их жизнеспособность, как сообщалось ранее. | 1.8 |
Они установили, что некоторые гены, участвующие в сигнальных путях, связанных с RHO, были заняты GATA2 в KRAS-мутантных, но не в опухолевых клетках дикого типа. | Исследователи объединили доступные ингибиторы, селективные для двух путей сигналинга, регулируемых GATA2, для лечения мышей с Kras-ассоциированными NSCLC. | 2 |
Данные in vivo все еще являются предварительными, а другие потенциальные препятствия, такие как резистентность к препаратам, не были изучены. | Модель GEM, использованная в данном исследовании, сохраняет дикий тип Tp53, что позволяет предположить, что опухоли, успешно поддающиеся лечению бортезомибом и фасудилом, могут быть менее агрессивными по сравнению с таковыми у большинства пациентов с NSCLC. | 0 |
Несмотря на эти ограничения, результаты исследования представляют собой значительный прогресс в многолетней борьбе с раком легких. | Следует рассматривать данные исследования как многообещающий, но ранний этап длительного процесса разработки лекарственных препаратов. | 0.8 |
В данном исследовании, в поисках агентов, способных избирательно уничтожать клетки с мутацией KRAS, было обнаружено, что подавление экспрессии GATA2 синтетически летально в сочетании с мутацией KRAS. | Неудивительно, что нокдаун GATA2 в KRAS-мутантных клетках привел к выраженному снижению уровня активных GTP-связанных RHO-белков, включая нижестоящую киназу ROCK. | 2.2 |
В опухолях лёгких уровни TRAF6 могут повышаться несколькими механизмами. | GATA2lox/lox Спорадическая инфекция клеток легких вирусом Adeno-Cre Потеря GATA2 индуцирует регрессию установленных опухолей | 1.4 |
GATA2 также представляет значительный интерес; генетическая абляция приводит к регрессии опухоли в мышиных моделях аденокарциномы легкого, и хотя этот транскрипционный фактор может казаться наименее перспективной мишенью, его роль в регуляции протеасомы указала на терапевтические подходы, которые выглядят весьма многообещающими. | Транскрипционный фактор GATA2, необходимый для онкогенного K-ras-зависимого развития опухолей легкого, связывается с промотором TRAF6 и усиливает его экспрессию. | 1.8 |
Субъединицы BAF53 и β-актина участвуют в опосредованном SWI/SNF связывании с хроматином/ядерным матриксом у млекопитающих. | β-актин и актин-связанные белки обнаружены в различных АТФ-зависимых хроматин-ремоделирующих комплексах. | 3 |
Белок hWts2 человека является мишенью фосфорилирования киназы Aurora-A, и данное фосфорилирование играет роль в регуляции центросомальной локализации hWts2. | Подобно PLK1, активность Aurora-A необходима для обогащения или локализации множества центросомных факторов, участвующих в процессах созревания, включая LATS2 и CDK5RAP2/Cnn. | 1.2 |
Изменения в экспрессии и/или связывающей способности miR-146a и miR-146b также связаны с метастатическим и пролиферативным ответом, ассоциированным с развитием папиллярной карциномы щитовидной железы (PTC), рака шейки матки, рака яичников, рака молочной железы, рака поджелудочной железы и рака предстательной железы. | Кроме того, потеря LATS2 стимулировала редупликацию, что сопоставимо с активностью, наблюдаемой при сверхэкспрессии Cyclin E в отсутствие p53. | 0.2 |
Мы не обнаружили явного влияния деплеции LATS2 на активность киназы Aurora-A при мониторинге по состоянию фосфорилирования Thr288 на Aurora-A, что позволяет предположить, что LATS2 может быть нижестоящим по отношению к Aurora-A, как упоминалось в предыдущем отчете. | Было показано, что miR-143, miR-145 и miR-34a подавляют пролиферацию клеток, а miR-146a и miR-21 стимулируют их рост. | 0.2 |
Транскрипционные сети, зависимые от Oct-4, были описаны как регуляторы самообновления и плюрипотентности в ES- и EC-клетках человека и мыши, а также в мезенхимальных клетках человека. | В одном исследовании сообщается о повышении экспрессии данной miR по данным qRT-PCR, тогда как метод секвенирования и микроматричный анализ указывают на подавление miR-133b в опухолевой ткани. | 0.6 |
Генетические и функциональные исследования свидетельствуют, что неоморфные мутации IDH способствуют миелоидной трансформации, по крайней мере частично, путём ингибирования ферментативной функции TET. | Повышение экспрессии miR-24 также наблюдалось при раке желудка и шейки матки. | 0.2 |
В клетках PC9 утрата GATA6 и/или HOPX не влияла на рост клеток, тогда как снижение уровня GATA2 и EGFR подавляло жизнеспособность клеток, как сообщалось ранее. | Aurora-A необходима для правильной локализации и функционирования центросомных компонентов, таких как центрозомин, NDEL1, LATS и TACC-белки. | 0.2 |
Центросомы увеличиваются как в размере, так и в способности нуклеации микротрубочек непосредственно перед вступлением в митоз. | Функциональные исследования показали, что введение miR-146a в клеточные линии способствует пролиферации клеток рака шейки матки, что указывает на онкогенную роль данной miRNA при этом типе рака. | 0 |
В отношении LATS2 сообщалось, что данный белок индуцирует остановку клеточного цикла в фазе G2/M и последующую гибель клеток путем апоптоза. | Экспрессия miR-146a демонстрирует повышенный уровень при папиллярной карциноме щитовидной железы, анапластическом раке щитовидной железы и раке шейки матки. | 0.2 |
Повышенная экспрессия miR-146a также была выявлена в тканях рака шейки матки. | Подобно PLK1, активность Aurora-A необходима для обогащения или локализации множества центросомных факторов, участвующих в процессах созревания, включая LATS2 и CDK5RAP2/Cnn. | 0.2 |
Некроптоз также является частью защиты организма от вирусных инфекций. | Некротическая гибель усиливалась при подавлении активности каспаз вирусными или химическими ингибиторами. | 2 |
Некротическая гибель усиливалась, когда активность каспаз подавлялась как вирусными, так и химическими ингибиторами. | Интересно, что в присутствии ингибиторов каспаз или после абляции гена caspase-8 рецепторы смерти также недавно продемонстрировали способность индуцировать некротическую гибель клеток. Этот процесс зависит от киназной активности RIPK1 и RIPK3. | 2.8 |
Ингибитор циклин-зависимой киназы (CDK) рсковитин, как сообщается, подавляет экспрессию антиапоптотического белка Mcl-1. | Недавние исследования на модельных системах и случаях острого миелоидного лейкоза показали, что экспрессия MCL-1 является ключевым фактором развития резистентности к ABT-737. | 2 |
Повышение регуляции miR-146a также было обнаружено в тканях рака шейки матки. | Экспрессия miR-146a усиливается при раке шейки матки. | 4 |
В начале митоза LATS2 активируется путем фосфорилирования и играет важную роль в переходе G2/M в культивируемых клетках. | Lats2/Kpm гомологичен Lats1 и подвергается фосфорилированию, зависящему от клеточного цикла | 3 |
Как ни парадоксально, Rest недавно был описан одновременно в качестве супрессора опухолей и онкогена. | В эпителиальных клетках человека REST был описан как мощный супрессор злокачественной трансформации, а его дисрегуляция ассоциирована с несколькими ненеирональными опухолями, включая рак молочной железы и мелкоклеточный рак легкого. | 3.2 |
Изменения экспрессии Oct-4 стимулируют дифференцировку и приводят к детерминации примитивных прогениторов эктодермального, энтодермального или мезодермального происхождения. | OCT4, транскрипт гена POU5F1, участвует в поддержании плюрипотентности стволовых клеток, их самообновления и структуры хроматина, а также способствует росту опухоли в дозозависимом режиме. | 1.6 |
Три программы, PicTar, miRanda и TargetScan, использовали для прогнозирования мишеней miR-21. | Гены, экспрессия которых снизилась в 2 раза и более, были дополнительно проанализированы на наличие потенциальных сайтов связывания miR-372/3 с использованием локальной версии алгоритма TargetScan. | 2.4 |
Последние исследования показали, что первые восемь нуклеотидов 5′-конца miRNA могут коррелировать с эффективной трансляционной репрессией. | Несовпадения вблизи 5′-конца малой РНК полностью устраняли подавление трансляции. | 3.2 |
Онкогенные мутации KRAS часто встречаются при раковых заболеваниях. | Примечательно, что c-Raf недавно был идентифицирован как необходимый фактор для развития K-Ras-зависимых NSCLC. | 1.8 |
Это переведенная на русский язык версия mteb/biosses-sts - Biomedical Semantic Similarity Estimation.
Метрики некоторых моделей ( через косинусное сходство):
| Модель (cls-pooling) | Pearson | Spearman | MAE | RMSE |
|---|---|---|---|---|
| jinaai/jina-embeddings-v3 | 0.8222 | 0.7768 | 2.2463 | 2.4468 |
| cointegrated/rubert-tiny2 | 0.6897 | 0.6793 | 2.1546 | 2.3944 |
| DeepPavlov/rubert-base-cased | 0.2982 | 0.4966 | 2.7042 | 2.9374 |
| ai-forever/ruRoberta-large | -0.0096 | 0.0219 | 2.3931 | 2.6905 |
| Модель (mean-pooling) | Pearson | Spearman | MAE | RMSE |
|---|---|---|---|---|
| jinaai/jina-embeddings-v3 | 0.8367 | 0.7927 | 2.1071 | 2.2987 |
| DeepPavlov/rubert-base-cased | 0.5711 | 0.5673 | 2.2598 | 2.5020 |
| cointegrated/rubert-tiny2 | 0.5361 | 0.5189 | 2.0358 | 2.2971 |
| ai-forever/ruRoberta-large | 0.3731 | 0.4199 | 2.5471 | 2.7887 |
- Downloads last month
- 126