anchor
stringlengths 24
220
| positive
stringlengths 403
2.17k
|
|---|---|
Eukaryotlarda NNR kodonlarının doğru çözülmesi için 5 s 2 U gereklidir.
|
tRNA'daki wobble modifikasyonu, 5-metokarbonilmetil-2-tiouridin (mcm(5)s(2)U), eukariotlarda NNR kodonlarının doğru dekodlanmasını gerektirir. 2-tiou grubu, mcm(5)s(2)U'nun konformasyonel sağlamlığını sağlayarak C3'-endo ribozun pükürme durumunu büyük ölçüde sabitlemeye yardımcı olur, bu da kararlı ve doğru kodon-antikodon eşleşmesini garanti eder. Saccharomyces cerevisiae'de (S. cerevisiae) beş gen, YIL008w (URM1), YHR111w (UBA4), YOR251c (TUM1), YNL119w (NCS2) ve YGL211w (NCS6), mcm(5)s(2)U'nun 2-tiolasyonunu gerektiren genler olarak tanımladık. In vitro bir sülfür transfer deneyi, Tum1p'nin Nfs1p'nin cistein desülfurazını uyardığını ve Nfs1p'den persülfit sülfürleri aldığını ortaya koydu. URM1, bir ubiquitin-ilişkili modifikatör, ve UBA4, bir E1 benzeri enzimdir ve protein urmilasyonu ile ilgilidir. Urm1p'nin karboksi-termi, bir akil-adenilat (-COAMP) olarak etkinleştirildi, ardından Uba4p tarafından tiokarboksilat (-COSH) olarak işlendi. Etkinleştirilmiş tiokarboksilat, 2-tiouridin oluşumuna yönelik sonraki reaksiyonlar için kullanılabilir, bu da Ncs2p/Ncs6p tarafından kolaylaştırılır. In vitro'da rekombine proteinler kullanarak 2-tiouridin oluşumunu başarıyla yeniden oluşturabildik. Bu çalışma, 2-tiouridin oluşumunun protein urmilasyonu ile paylaşılan bir yol ve kimyasal reaksiyonlar olduğunu ortaya koydu. Eukariotik 2-tiouridin oluşumunun sülfür akışı, bakteriyel sülfür iletim sisteminin persülfit kimyasallarına dayalı mekanizmasından farklıdır.
|
miR-142-5P, vücut sıcaklığının yükselmesi için bilinen bir düzenleyicidir.
|
Ateş, hastalığın teşhisi için yaygın olarak kullanılır ve kritik şekilde hasta olan hastalarda sürekli olarak artan ölümle ilişkilendirilir. Bununla birlikte, vücut sıcaklığının moleküler kontrolleri iyi anlaşılmamıştır. 30 ateşli hastada ve 40 °C'de tutulan THP-1 türevi makrofajlarda RNA bağlama motifi proteini 3'ün (RBM3) ifadesinin azaldığını keşfettik, bu protein soğuk strese yanıt verir ve mikroRNA (miRNA) ifadesini düzenler. Önemli bir şekilde, RBM3 ifadesi, gösterilebilir bir enfeksiyon olup olmamasına bakılmaksızın ateş sırasında azalır. Azalmış RBM3 ifadesi, termomiR olarak adlandırdığımız, RBM3'e hedef olan sıcaklık duyarlı miRNA'ların artmasına neden olur. TermomiR'ler, miR-142-5p ve miR-143 gibi, endojen pirojenler olan IL-6, IL6ST, TLR2, PGE2 ve TNF'i hedefler ve bu da patolojik hipertermiyi önlemek için negatif geri besleme mekanizmasını tamamlar. Normal PBMC'lerin 40 °C gibi ateş benzeri sıcaklığa maruz bırakılması ile, azalan RBM3 seviyelerinin miR-142-5p ve miR-143 seviyelerinin artmasıyla ve bunun tersi ile ilişkili bir eğilim gösterdiğimizi daha da kanıtladık. Toplu olarak, sonuçlarımız, RBM3 seviyelerinin azalması ve miR-142-5p ve miR-143'ün ifadesinin artması yoluyla ateşi düzenleyen negatif geri besleme döngüsünün varlığını gösterir.
|
miR-142-5P, sıcaklık duyarlı bir mikroRNA (miRNA)'dır.
|
Ateş, hastalığın teşhisi için yaygın olarak kullanılır ve kritik şekilde hasta olan hastalarda sürekli olarak artan ölümle ilişkilendirilir. Bununla birlikte, vücut sıcaklığının moleküler kontrolleri iyi anlaşılmamıştır. 30 ateşli hastada ve 40 °C'de tutulan THP-1 türevi makrofajlarda RNA bağlama motifi proteini 3'ün (RBM3) ifadesinin azaldığını keşfettik, bu protein soğuk strese yanıt verir ve mikroRNA (miRNA) ifadesini düzenler. Önemli bir şekilde, RBM3 ifadesi, gösterilebilir bir enfeksiyon olup olmamasına bakılmaksızın ateş sırasında azalır. Azalmış RBM3 ifadesi, termomiR olarak adlandırdığımız, RBM3'e hedef olan sıcaklık duyarlı miRNA'ların artmasına neden olur. TermomiR'ler, miR-142-5p ve miR-143 gibi, endojen pirojenler olan IL-6, IL6ST, TLR2, PGE2 ve TNF'i hedefler ve bu da patolojik hipertermiyi önlemek için negatif geri besleme mekanizmasını tamamlar. Normal PBMC'lerin 40 °C gibi ateş benzeri sıcaklığa maruz bırakılması ile, azalan RBM3 seviyelerinin miR-142-5p ve miR-143 seviyelerinin artmasıyla ve bunun tersi ile ilişkili bir eğilim gösterdiğimizi daha da kanıtladık. Toplu olarak, sonuçlarımız, RBM3 seviyelerinin azalması ve miR-142-5p ve miR-143'ün ifadesinin artması yoluyla ateşi düzenleyen negatif geri besleme döngüsünün varlığını gösterir.
|
MikroRNA'lar, düşük seviyedeki "sızıntılı" transkripsiyonu baskılayarak homeostazı korur.
|
MikroRNA'lar (miRNA'lar), gen ifadesini dizinlere bağlı olarak baskılayan, kısa ve yüksek derecede korunmuş, kodlamayan RNA molekülleridir. Tek hücre ölçümleri yapmak için nicel floresan mikroskopisi ve akış sitometri kullandık ve miRNA ile düzenlenmeyen bir hedef genin protein ifadesini izledik. Bulgularımıza göre, ortalama baskılama düzeyi, önceki nüfus temelli ölçümlerle uyumlu olarak mütevazı olsa da, bireysel hücreler arasında baskılama dramatik şekilde değişir. Özellikle, miRNA'lar tarafından yapılan düzenlemenin, hedef mRNA'nın bir eşik seviyesinin altında protein üretimi yüksek derecede baskılanmasını sağladığını gösteriyoruz. Bu eşik seviyesine yakın, protein ifadesi, hedef mRNA girdisine duyarlı bir şekilde tepki verir, bu da moleküler titrasyon matematiksel modeline uygundur. Bu sonuçlar, miRNA'ların hem bir anahtar hem de gen ifadesinin hassas ayarlayıcısı olarak işlev görebileceğini göstermektedir.
|
MikroRNA'lar, düşük seviyedeki "sızıntılı" transkripsiyonu baskılayarak homeostazı korur.
|
Biyolojik sistemler, çevresel ve genetik bozulmalara rağmen işlevlerini sürdürmek için çeşitli mekanizmalar kullanır. Artan kanıtlar, mikroRNA'ların (miRNA'lar) gen ifadesini posttranskripsiyonel olarak bastırma rollerinin yanı sıra, transkripsiyonel programları güçlendirerek ve anormal transkriptleri azaltarak biyolojik süreçlere dayanıklılık sağladığını ve bazı ağ bağlamlarında transkript kopyası sayısındaki rastgele dalgalanmaları baskılayabileceğini öne sürmektedir. Bu aktiviteler, normal gelişim ve fizyoloji, hastalık ve evrim için önemli sonuçlara sahiptir. Burada, hayvan sistemlerinde dayanıklılığa katkıda bulunan miRNA'ların örneklerini ve ilkelerini tartışacağız.
|
miRNA'lar hücrelerde homeostazı korumak için benzersiz bir mRNA kümesini düzenler.
|
Yeni veriler, mikroRNA'ların (miRNA'lar) gelişimden daha çok tanındıkları rolün ötesinde çeşitli stres yanıtlarında kritik bir rol oynadıklarını göstermektedir. Şaşırtıcı bir şekilde, normalde hedef transkriptlerin ifadelerini baskılayan miRNA'lar, stres sırasında ifade aktivatörleri haline gelebilirler. Bu, miRNA/Argonaute komplekslerinin stres sırasında farklı subselerel bölümlere taşınan RNA bağlayıcı proteinlerle yeni etkileşimlerine kısmen açıklanabilir.
|
p16INK4A'nın bozulması, ileri aşamadaki Oral Olası Kanserli Lezyonlar (OPML)lerin mikroinvazif adımından kaynaklanan anormal bir yara yanıtıyla ilişkilidir.
|
Vücut içinde kanser ve yaşlanma izleme, deneysel açıdan hala zorlu bir görevdir. Burada, p16(LUC) adlı bir luciferaz knockin fare (p16(LUC)), p16(INK4a), bir tümör baskılayıcı ve yaşlanma biyomarkeri olan genin güvenilir bir şekilde rapor ettiğini açıklıyoruz. p16(+/LUC) farelerinde ömür boyu lüminesans değerlendirmesi, yaşlanma ile birlikte eksponansiyel bir artış gösterdi, bu da aynı anda barındırılan, aynı türden fareler arasında yüksek değişkenliğe sahipti. Yaşlanma ile birlikte p16(INK4a) geninin ifadesi, kanser gelişimini tahmin etmedi, bu da senesans hücrelerinin birleşmeinin kanserle ilişkili ölümün ana belirleyicisi olmadığına işaret ediyor. Test edilen 14 kanser modelinin tamamında, p16(LUC) geninin erken neoplazik olaylara odaklı olarak etkinleştirilmesi, diğer görüntüleme tekniklerinden daha yüksek duyarlılıkla tümörleri görselleştirme imkanı sağladı. p16(INK4a) geninin etkinleşmesi, ortaya çıkan tümörde ve çevresindeki stromal hücrelerde gözlemlendi. Bu çalışma, p16(INK4a) geninin etkinleşmesinin tüm ortaya çıkan kanserlerin bir özelliği olduğunu öne sürüyor, bu da p16(LUC) alelinin neoplazik dönüşümün tarafsız ve duyarlı bir raporörü olduğunu gösteriyor.
|
p16INK4A'nın bozulması CDKN2A tarafından kodlanır.
|
Vücut içinde kanser ve yaşlanma izleme, deneysel açıdan hala zorlu bir görevdir. Burada, p16(LUC) adlı bir luciferaz knockin fare (p16(LUC)), p16(INK4a), bir tümör baskılayıcı ve yaşlanma biyomarkeri olan genin güvenilir bir şekilde rapor ettiğini açıklıyoruz. p16(+/LUC) farelerinde ömür boyu lüminesans değerlendirmesi, yaşlanma ile birlikte eksponansiyel bir artış gösterdi, bu da aynı anda barındırılan, aynı türden fareler arasında yüksek değişkenliğe sahipti. Yaşlanma ile birlikte p16(INK4a) geninin ifadesi, kanser gelişimini tahmin etmedi, bu da senesans hücrelerinin birleşmeinin kanserle ilişkili ölümün ana belirleyicisi olmadığına işaret ediyor. Test edilen 14 kanser modelinin tamamında, p16(LUC) geninin erken neoplazik olaylara odaklı olarak etkinleştirilmesi, diğer görüntüleme tekniklerinden daha yüksek duyarlılıkla tümörleri görselleştirme imkanı sağladı. p16(INK4a) geninin etkinleşmesi, ortaya çıkan tümörde ve çevresindeki stromal hücrelerde gözlemlendi. Bu çalışma, p16(INK4a) geninin etkinleşmesinin tüm ortaya çıkan kanserlerin bir özelliği olduğunu öne sürüyor, bu da p16(LUC) alelinin neoplazik dönüşümün tarafsız ve duyarlı bir raporörü olduğunu gösteriyor.
|
p75 NTR - ilişkili hücre ölümü yürütücüsü (NADE), p75 NTR ölüm alanıyla etkileşime girer.
|
Çok işlevli sinyal protein p75 nörotrofin reseptörü (p75(NTR)), kötü huylu glioomların yüksek derecede invazif doğasını düzenleyen ve katkıda bulunan merkezi bir düzenleyicidir. Burada, p75(NTR) ile ilişkili nörotrofin bağımlı iç zar proteolizi (RIP) gerektiren p75(NTR) tarafından aracılık edilen glioom invazyonunu gösterdiğimizi ve hedefli glioom terapisi için daha önce bilinmeyen bir süreci tanımladığımızı gösteriyoruz. p75(NTR) veya p75(NTR) pozitif intracranial tümörlere sahip hayvanlara klinik olarak uygulanabilir gamma-secretaz inhibitörleri ile tedavi etme veya p75(NTR) veya p75(NTR) dirençli kimerasların ifadesi, glioom invazyonunda dramatik bir azalmaya ve hayatta kalma süresinin uzamasına neden oldu. Önemli olan, p75(NTR) proteolizinin p75(NTR) pozitif hasta tümör örneklerinde ve beyin tümör başlatıcı hücrelerde gözlemlendiği gerçeğidir. Bu çalışma, p75(NTR)'nin terapötik hedef olarak önemini vurgulamakta ve gamma-secretaz inhibitörlerinin kötü huylu glioom tedavisinde doğrudan klinik uygulamaya sahip olabileceğini öne sürmektedir.
|
qSOFA puanları, acil serviste yatan hastaların yatış süresine ilişkilidir.
|
## Önem
Sepsis-3 Kriterleri, Sekansel [Sepsis ile İlgili] Organ Yetmezliği Değerlendirme (SOFA) puanında 2 veya daha fazla nokta değişiminin değerini vurguladı, hızlı SOFA (qSOFA) tanı yöntemini tanıttı ve sistemik enflamatuar yanıt sendromu (SIRS) kriterlerini sepsis tanısından çıkardı.
## Amaç
Dış doğrulama ve kritik hasta popülasyonunda enfeksiyon şüphesi olan hastalarda sonuçlara yönelik olarak SOFA puanında 2 veya daha fazla nokta artışı, 2 veya daha fazla SIRS kriteri veya qSOFA puanında 2 veya daha fazla nokta artışının ayrım gücünü değerlendirmek.
## Tasarım, Ortam ve Katılımcılar
2000-2015 yılları arasında Avustralya ve Yeni Zelanda'daki 182 yoğun bakım ünitesinde (ICU) 184.875 enfeksiyonla ilişkili birincil kabul tanısı olan hastalar üzerinde geriye dönük kohort analizi.
## Maruz Kalma
SOFA, qSOFA ve SIRS kriterleri, ICU kabulünden 24 saat içinde toplanan verilere uygulandı.
## Ana Çıktılar ve Ölçümler
Ana sonuç, hastanede ölüm idi. Hastanede ölüm veya 3 gün veya daha fazla ICU kalış süresi, bileşik bir ikincil sonuçtu. Ayrım gücü, alıcı işletme karakteristik eğrisi (AUROC) kullanılarak değerlendirildi. Temel risk, puanlama sistemlerinden bağımsız değişkenler kullanılarak belirlenen bir model kullanılarak ayarlanmış analizler yapıldı.
## Bulgular
184.875 hasta (ortalama yaş 62,9 yıl [SD, 17,4]; kadın 82.540 [44,6%]; en yaygın tanı bakteriyel pnömoni 32.634 [17,7%]) üzerinde, toplam 34.578 hasta (18,7%) hastanede öldü ve 102.976 hasta (55,7%) hastanede ölüm veya 3 gün veya daha fazla ICU kalış süresi yaşadı. SOFA puanı 2 veya daha fazla nokta arttı (90,1%); 86,7% hastada 2 veya daha fazla SIRS krit
|
R-protein chaperonları, R-protein bağlayıcı ortakları ile komplekslerde bulunur.
|
Ribozomların biyojenesi, tüm ökaryotlarda korunmuş temel bir hücresel süreçtir ve ribozom bileşenlerinin montajı, modifikasyonu ve hücre içi çeşitli bölümlere taşınması için >170 genin gerektirdiği bilinmektedir. Yoğun çalışma rağmen, bu yolun birçok ek geni içerdiği tahmin edilmektedir. Burada, son fonksiyonel genomik ve proteomik çalışmaların avantajlarından yararlanan ve biyolojik süreçlerle aday genleri ilişkilendiren ağa yönlendirilmiş genetikler yaklaşımını kullanarak ek ribozom biyojenesi genlerini bilgisayar ortamında tanımlıyoruz. Yaklaşık 100 aday genin deneysel olarak değerlendirildiği bir dizi testte, en az 15 yeni genin katılımını doğruladık, bunlardan bazıları daha önce karakterize edilmemiş genlerdir (YDL063C, YIL091C, YOR287C, YOR006C/TSR3, YOL022C/TSR4). Yeni genleri, ribozom alt biriminin olgunlaşması, ribozom parçacığının ilişkili olması ve ribozom alt biriminin nükleer dışa çıkması gibi belirli yönlerle ilişkilendiriyoruz ve 5S, 7S, 20S, 27S ve 35S rRNA'ların işlenmesinde özellikle gerekli olan genleri belirtiyoruz. Bu sonuçlar, ribozom biyojenesi ile mRNA splisleme arasındaki yeni bağlantıları ortaya koyuyor ve bu yolun %10'un üzerinde yeni geni-çoğunlukla insan ortologlarına sahip-ekliyor, bu da evrensel olarak korunmuş bir ökaryotik sürecin anlayışımızı önemli ölçüde genişletiyor.
|
A20'nin siRNA ile baskılanması, bir in vivo fare xenograft modelinde tümör ilerlemesini hızlandırır.
|
Glioblastomlar, işlevsel bir hücre hiyerarşisiyle karakterize edilen ve kendini yenileyen glioblastoma kök hücreleri (GSC) tarafından desteklenen ölümcül kanserlerdir. GSC'ler, ana tümörden farklı moleküler yolaklar tarafından düzenlenir ve bu yolaklar potansiyel olarak terapötik hedefler olarak kullanılabilir. A20 (TNFAIP3), hücre hayatta kalmasını ve NF-kappaB yolunu düzenleyen bir düzenleyici, hem mRNA hem de protein düzeylerinde GSC'lerde normal glioblastoma hücrelerine kıyasla aşırı ifade edilmiştir. A20'nin GSC'lerdeki işlevsel önemini belirlemek için, kısa saçlı RNA (shRNA) ile A20 ifadesini hedefledik. A20 ifadesini baskılamak, GSC büyümesini ve hayatta kalmasını, hücre döngüsü ilerlemesinin azalması ve p65/RelA fosforlamasının azalması ile ilişkili mekanizmalar yoluyla azalttı. GSC'lerdeki A20'nin yüksek seviyeleri, apoptoz direncine katkıda bulundu: GSC'ler, eşleşen non-kök glioma hücrelerine kıyasla TNFalpha'ya karşı daha az duyarlıydı, ancak A20'nin baskılanması, GSC'leri TNFalpha ile medyasyonda apoptoza duyarlı hale getirdi. GSC'lerin hayatta kalmasının azalması, bu hücrelerin birincil ve ikincil nörospere oluşum testlerinde kendini yenileme yeteneğini azalttı. A20 hedeflemesi, insan glioma xenograft'ları taşıyan farelerde hayatta kalmayı artırdı. Glioma hastası genomik veritabanı analizi, A20'nin aşırı ifadesi ve amplifikasyonunun hayatta kalma ile ters orantılı olduğunu göstermektedir. Bu veriler birlikte, A20'nin glioma alt popülasyonu olan glioblastoma kök hücrelerinin korunmasında rol oynadığını göstermektedir. Lymphoma'da inaktifleştiren mutasyonlar olmasına rağmen, A20'nin tümör baskılayıcı bir gen olarak işlev görebileceğini gösteren benzer nokta mutasyonları glioma genomik dizilemede tanımlanmamıştır. Aslında, verilerimiz, A20'nin glioma'da tümör artıcısı olarak işlev görebileceğini, GSC hayatta kalmasını teşvik ederek göstermektedir. Bu nedenle, A20 antikanser terapileri dikkat
|
A20'nin siRNA ile baskılanması, bir in vivo fare xenograft modelinde tümör ilerlemesini hızlandırır.
|
A20, TNF tarafından indüklenen bir birincil yanıt geni olup, çeşitli kanser hücrelerinde antiapoptotik işlevi olduğu bulunmuştur. Bu çalışma, insan glioom dokularında ve dört glioom hücre hattında A20 ifadesini inceler ve glioom hücrelerinin tümör oluşumunu ve bir fare tümör modeli üzerindeki etkisini araştırır. YÖNTEMLER İnsan glioom dokusu örnekleri ve hücreleri, ters transkripsiyon-PCR (RT-PCR), batı blot ve immünohistokimya ile incelendi. Glioom hücreleri, akış sitometresi ile test edildi. Fare tümör modeli, A20'nin spesifik siRNA'ların tümör oluşumuna etkisini incelemek için kullanıldı. SONUÇLAR A20, klinik glioom dokusu örneklerinin (63,9%) çoğunda aşırı ifade edildi ve klinik evreleme ile ilişkiliydi. Dört insan glioom hücre hattından hepsi A20 ifade etti, bunlardan U87 en güçlü ifade sinyallerini gösterdi. A20'nin ifadesini in vitro siRNA'lar ile inhibe etmek, glioom hücrelerinin büyüme hızlarını azalttı ve G1/S duraklamasına ve artmış apoptoza neden oldu. Bir fare tümör modelinde, yerel siRNA yönetimi, sağlam tümör büyümesini önemli ölçüde baskıladı. SONUÇ A20, hem insan glioom dokularında hem de hücre hatlarında aşırı ifade edildi ve A20'nin ifadesini inhibe etmek, kültürde ve farelerde glioom hücrelerinin büyümesini büyük ölçüde yavaşlattı. Bu bulgular, A20'nin insan glioomun tümör oluşumunda rol oynadığını ve gelecekteki tedavi hedefi olarak hizmet edebileceğini göstermektedir.
|
A20'nin siRNA ile baskılanması, bir in vivo farı xenograft modelinde tümör ilerlemesini yavaşlatır.
|
Glioblastomlar, işlevsel bir hücre hiyerarşisiyle karakterize edilen ve kendini yenileyen glioblastoma kök hücreleri (GSC) tarafından desteklenen ölümcül kanserlerdir. GSC'ler, ana tümörden farklı moleküler yolaklar tarafından düzenlenir ve bu yolaklar potansiyel olarak terapötik hedefler olarak kullanılabilir. A20 (TNFAIP3), hücre hayatta kalmasını ve NF-kappaB yolunu düzenleyen bir düzenleyici, hem mRNA hem de protein düzeylerinde GSC'lerde normal glioblastoma hücrelerine kıyasla aşırı ifade edilmiştir. A20'nin GSC'lerdeki işlevsel önemini belirlemek için, kısa saçlı RNA (shRNA) ile A20 ifadesini hedefledik. A20 ifadesini baskılamak, GSC büyümesini ve hayatta kalmasını, hücre döngüsü ilerlemesinin azalması ve p65/RelA fosforlamasının azalması ile ilişkili mekanizmalar yoluyla azalttı. GSC'lerdeki A20'nin yüksek seviyeleri, apoptoz direncine katkıda bulundu: GSC'ler, eşleşen non-kök glioma hücrelerine kıyasla TNFalpha'ya karşı daha az duyarlıydı, ancak A20'nin baskılanması, GSC'leri TNFalpha ile medyasyonda apoptoza duyarlı hale getirdi. GSC'lerin hayatta kalmasının azalması, bu hücrelerin birincil ve ikincil nörospere oluşum testlerinde kendini yenileme yeteneğini azalttı. A20 hedeflemesi, insan glioma xenograft'ları taşıyan farelerde hayatta kalmayı artırdı. Glioma hastası genomik veritabanı analizi, A20'nin aşırı ifadesi ve amplifikasyonunun hayatta kalma ile ters orantılı olduğunu göstermektedir. Bu veriler birlikte, A20'nin glioma alt popülasyonu olan glioblastoma kök hücrelerinin korunmasında rol oynadığını göstermektedir. Lymphoma'da inaktifleştiren mutasyonlar olmasına rağmen, A20'nin tümör baskılayıcı bir gen olarak işlev görebileceğini gösteren benzer nokta mutasyonları glioma genomik dizilemede tanımlanmamıştır. Aslında, verilerimiz, A20'nin glioma'da tümör artıcısı olarak işlev görebileceğini, GSC hayatta kalmasını teşvik ederek göstermektedir. Bu nedenle, A20 antikanser terapileri dikkat
|
A20'nin siRNA ile baskılanması, bir in vivo farı xenograft modelinde tümör ilerlemesini yavaşlatır.
|
A20, TNF tarafından indüklenen bir birincil yanıt geni olup, çeşitli kanser hücrelerinde antiapoptotik işlevi olduğu bulunmuştur. Bu çalışma, insan glioom dokularında ve dört glioom hücre hattında A20 ifadesini inceler ve glioom hücrelerinin tümör oluşumunu ve bir fare tümör modeli üzerindeki etkisini araştırır. YÖNTEMLER İnsan glioom dokusu örnekleri ve hücreleri, ters transkripsiyon-PCR (RT-PCR), batı blot ve immünohistokimya ile incelendi. Glioom hücreleri, akış sitometresi ile test edildi. Fare tümör modeli, A20'nin spesifik siRNA'ların tümör oluşumuna etkisini incelemek için kullanıldı. SONUÇLAR A20, klinik glioom dokusu örneklerinin (63,9%) çoğunda aşırı ifade edildi ve klinik evreleme ile ilişkiliydi. Dört insan glioom hücre hattından hepsi A20 ifade etti, bunlardan U87 en güçlü ifade sinyallerini gösterdi. A20'nin ifadesini in vitro siRNA'lar ile inhibe etmek, glioom hücrelerinin büyüme hızlarını azalttı ve G1/S duraklamasına ve artmış apoptoza neden oldu. Bir fare tümör modelinde, yerel siRNA yönetimi, sağlam tümör büyümesini önemli ölçüde baskıladı. SONUÇ A20, hem insan glioom dokularında hem de hücre hatlarında aşırı ifade edildi ve A20'nin ifadesini inhibe etmek, kültürde ve farelerde glioom hücrelerinin büyümesini büyük ölçüde yavaşlattı. Bu bulgular, A20'nin insan glioomun tümör oluşumunda rol oynadığını ve gelecekteki tedavi hedefi olarak hizmet edebileceğini göstermektedir.
|
Arabidopsis'teki taa1, tar1 ve tar2 üçlü mutanlar, embriyonik gelişim sırasında kök meristemi oluşturmazlar.
|
Bitkiler, çevre değişikliklerine uyum sağlamak için büyüme ve gelişimlerini uyarlama konusunda inanılmaz bir yeteneğe sahiptirler. Hormonal ve gelişimsel sinyaller arasındaki etkileşim, bu büyük esnekliğin oluşmasında kritik bir mekanizmadır. Etilen hormonu yanıtı, dokü türüne, gelişim aşamasına ve çevresel koşullara bağlı olarak iyi bir örnektir. Arabidopsis wei8 mutanta karakterize ederek, dokü-özgü etilen yanıtlarını araştıran küçük bir gen ailesinin varlığını keşfettik. Biyokimyasal çalışmalar, WEI8'in, indol-3-piruvik asit (IPA) dalının, auxin biyosentez yolunda esansiyel ancak genetik olarak karakterize edilmemiş olan tryptofan aminotransferaz, TAA1'i kodladığını ortaya koydu. TAA1 ve paraloglarının analizi, yerel auxin üretiminin, dokü-özgü etilen etkilerine ve organ gelişimine bağlanmasını sağladı. Bu nedenle, IPA auxin üretim yolu, çevre ve gelişimsel uyaranlara yanıt olarak güçlü auxin gradyanlarının oluşmasında kilit rol oynamaktadır.
|
β-yüzey açılması, pleurotolizin por oluşumu sırasında gerçekleşir.
|
Membran saldırı kompleksi/perforin benzeri (MACPF) proteinler, por oluşturma proteinlerinin en büyük süper ailesini oluşturur ve bağışıklık ve patogenezde kritik roller oynar. Solunabilir monomerler, konformasyonel geçişler yoluyla büyük membran porlarına toplanır ve bu geçişler hala yapısal ve mekanizmik olarak karakterize edilmemiştir. Burada, 11 Å çözünürlükte kriyo elektron mikroskopisi (kriyo-EM) yapısının yanı sıra her iki bileşenin (lipid bağlayan PlyA proteini ve por oluşturma MACPF bileşeni PlyB) kristal yapılarını sunuyoruz. Bu veriler, 13 katlı, 80 Å çapında ve 100 Å yüksekliğinde bir por açıklıyor. Her alt birim, PlyB molekülü üzerine bir membran bağlı PlyA dimeri içerir. EM haritasının çözünürlüğü ve biyofiziksel ve hesaplamalı deneyler, MACPF por birleştirmesindeki alt alanların güvenli atanmasını sağladı. PlyB'deki ana konformasyonel değişiklikler, MACPF alanındaki bükülmüş ve çarpık merkezi β-sayfanın yaklaşık 70° açılmasıdır, bu da iki α-heliks bölgesini (TMH1 ve TMH2) transmembran β-saçları (TMH1 ve TMH2) olarak dışarı çıkarır ve yeniden katlar. Üç farklı disülfit bağ tuzağında tutulan hazır por ara yapılarını belirledik. Bu verileri moleküler modelleme ve esnek uydurma ile analiz ederek, β-sayfanın açılması için olası bir trajektori oluşturduk. Sonuçlar, MACPF konformasyonel değişikliğinin, bir korunmuş heliks-döndürme-heliks motifinin TMH2'nin üstüne etkileşiminin bozulması ile tetiklendiğini öne sürüyor. Serbest bırakıldıktan sonra, transmembran bölgelerin β-saçları oluşturmak için üstten aşağıya zıplayan hidrojen bağlarının arka arkaya bağlanmasıyla bir por oluşturduklarını öneriyoruz. MACPF alanındaki ara yapılar, solunabilir monomerden por'a geçiş için bir yapısal paradigm sağlar ve bu, süper ailenin tamamında korunmuş olabilir. TMH2 bölgesi, her iki TMH kümesinin serbest bırakılmasında kritik olduğu için, bu bölgenin doğal MACPF işlevi inhibitörleri tarafından hedeflenmesinin nedenini
|
β1/Ketel, mikrotubülleri bağlayabilir.
|
Mikrotüplü (MT) sitoplazmik iskelet, hücre fonksiyonunun birçok yönünü desteklemek için gereklidir, bunlara içsel maddelerin taşınması, hücre polaritesinin korunması ve mitozun düzenlenmesi dahildir. Bu fonksiyonlar, MT'lere bağlanarak özelliklerini değiştiren MT ilişkili proteinler (MAP'ler) tarafından koordine edilir. Drosophila embriyolarının erken aşamalarında, MT kosedimentasyon testi ile birlikte 1D ve 2D PAGE ve kütle spektrometresi kullanarak 250'den fazla MAP tanımladık. Bu yaklaşımla izole edilen yeni MAP'lerin hücresel fonksiyonlarını analiz etmek için iki tamamlayıcı yöntem kullandık. İlk olarak, MT organizasyonunda rol oynayan 21 daha önce karakterize edilmemiş geni belirlemek için RNA müdahalesi (RNAi) ekranı gerçekleştirdik. İkinci olarak, protein etkileşim verilerine dayalı ikili protein etkileşim analizi yaparak MAP'lerin olası etkileşim ağlarını ürettik. Her iki yaklaşımı da birleştirerek, hücre döngüsü düzenlemesi ve mitozda potansiyel olarak önemli rollere sahip MAP komplekslerini tanımladık ve doğruladık. Bu çalışma, bu çok disiplinli yaklaşımla biyolojik olarak anlamlı verilerin elde edilebileceğini ve hücre bölünmesinde önemli görünen birçok yeni MAP'in tanımlandığını göstermektedir.
|
β1/Ketel, mikrotubülleri bağlayabilir.
|
P446L mutasyonu olan Drosophila importin-beta (P446L-imp-beta), dominant negatif bir şekilde nükleer zar (NE) montajını engelleyen bir protein olarak raporlanmıştır. P446L-imp-beta'nın çalışma mekanizmasını açıklarken, Sepharose topları üzerinde in vitro NE montajını incelemiş olduk. Drosophila embriyosu ekstraktları, Ran ile kaplanmış Sepharose topları üzerinde NE montajını desteklerken, P446L-imp-beta'nın ekstraktlara eklenmesiyle NE montajı gerçekleşmez. Ayrıca, importin-beta ile kaplanmış toplar üzerinde de bir NE oluşur. Şaşırtıcı bir şekilde, P446L-imp-beta, Sepharose toplarına bağlandığında, normal importin-beta kadar verimli bir şekilde NE vesiküllerini çeker. P446L-imp-beta'nın davranışındaki bu tutarsızlık, mikrotüb (MT) bağlama yeteneğinin, normal importin-beta'ya kıyasla arttığı ile ilgilidir. Normal importin-beta, MT'lere bağlanabilir ve RanGTP ile etkileşime girdiğinde bağlanma azalırken, P446L-imp-beta, RanGTP ile MT'lerden kaldırılamaz. P446L-imp-beta, normal importin-beta gibi, mitozun sonunda NE montajında gerekli olduğu bilinen bazı tipteki nucleoporinler ile bağlanır. Görünüşe göre, P446L-imp-beta'nın NE montajını engellemesi etkisi, bazı NE montajında gerekli olan nucleoporinleri MT'lere bağlayarak onları engellemesinden kaynaklanmaktadır.
|
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.