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P23865
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n4606
P23394
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n6137
P33334
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CAAGCAGCTTTACAGATCAATGGCGGAGGGAGGTCAACATCAAGAACTGTGGGCCTTTTATTGCCTATAGAACTTATAACGAACATGGTTCTTGCCTTTTACCAGAACCATCCGGGTGTTGTCTCCATAGAAACAGGTAAAGCTGTCCGTTACTGTGGGCTTGCCATATTTTTTGGAACT
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Q12460
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n338512
Q9NZI8
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MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSGKVELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESETAVVNVTYSNREQTRQAIMKLNGHQLENHALKVSYIPDEQIAQGPENGRRGGFGSRGQPRQGSPVAAGAPAKQQQVDIPLRLLVPTQYVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAGAAEKAISVHSTPEGCSSACKMILEIMHKEAKDTKTADEVPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLKKVEQDTETKITISSLQDLTLYNPERTITVKGAIENCCRAEQEIMKKVREAYENDVAAMSLQSHLIPGLNLAAVGLFPASSSAVPPPPSSVTGAAPYSSFMQAPEQEMVQVFIPAQAVGAIIGKKGQHIKQLSRFASASIKIAPPETPDSKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKLKEENFFGPKEEVKLETHIRVPASAAGRVIGKGGKTVNELQNLTAAEVVVPRDQTPDENDQVIVKIIGHFYASQMAQRKIRDILAQVKQQHQKGQSNQAQARRK
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Q00723
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End of preview. Expand in Data Studio

Dataset Card for ncRPI

Summary

The ncRPI dataset is part of the LUCAONE downstream tasks collection for biomolecular interaction prediction. It is structured for binary classification and includes standard splits for training (train.csv), validation (dev.csvval), and test (test.csv).

Dataset Structure

This dataset includes three splits:

  • train
  • val (converted from dev.csv)
  • test

Each split is in CSV format.

Task

Binary classification of interactions between biomolecular entities.

Source Path

Original download path: http://47.93.21.181/lucaone/DownstreamTasksDataset/dataset/ncRPI/gene_protein/binary_class/

Example Use

from datasets import load_dataset

ds = load_dataset("vladak/ncRPI")
print(ds["train"][0])

License

Please refer to the LUCAONE repository or contact the authors for licensing terms. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.10.592927v1.full.pdf

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